托马斯穆勒在拜仁历史的地位是独一份的，他在拜仁慕尼黑已经二十二年了，从青训时就展现出超人一等的天赋，也一直效力于拜仁，帮助拜仁获得过2次欧洲冠军联赛冠军（2019-2020赛季、2012-2013赛季）、10次德甲冠军、6次德国杯冠军、2次国际足联世界俱乐部杯冠军、2次欧洲超级杯冠军、7次德国超级杯冠军，历史地位相当超然。
托马斯穆勒对拜仁的衷心无可动摇，曾经为了拜仁拒绝了霍芬海姆的高薪招揽，职业生涯穆勒代表拜仁出战超过600场比赛，曾在2009-2010赛季和2013-2014赛季两度斩获联赛最佳射手。
穆勒个人能力超强，但在场上的存在感却难以被轻易发现，与他在德国国家队时的世界杯表现类似，但每当人们注意到他的时候，他就已经帮助球队制造破门良机了。穆勒跑位刁钻，门前嗅觉敏锐，射术精湛，这些都是他立足拜仁的重要基础，2021年11月19日，德甲第12轮，穆勒迎来拜仁慕尼黑生涯的第600场比赛里程碑，并在该场比赛中送出了自己当年的第20个助攻，追平了五大联赛自2007年以来的单个自然年的最高助攻记录。
2022年1月15日德甲联赛拜仁客场对战克隆的比赛中，穆勒在上半场就连续送出两记助攻，解锁了个人德甲的第150个助攻；同年3月8日，在2021-2022赛季欧冠决赛次回合中，穆勒独中两元，帮助拜仁7-1狂胜萨尔茨堡晋级八强，个人也以52粒欧冠进球超越亨利晋升至欧冠历史射手榜的第7位。
二十二年的青春岁月和职业生涯独一队的传奇仍在继续，穆勒打算在拜仁踢到2025年，届时穆勒已经36岁了，可能退役也可能离开拜仁去到新的俱乐部，但是穆勒带给拜仁球迷的快乐和精彩回忆永远会镌刻在拜仁史册上，一人一生一支队的传奇地位也无可撼动。
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